Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc47a1Q8K0H1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms