Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbrd1Q8K0B2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms