Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d5Q8JZW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms