Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf628Q8CJ78 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf628Q8CJ78 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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