Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hpf1Q8CFE2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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