Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp27Q8CEG8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp27Q8CEG8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp27Q8CEG8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp27Q8CEG8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Usp27Q8CEG8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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