Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh13Q8CEE7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh13Q8CEE7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh13Q8CEE7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh13Q8CEE7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rdh13Q8CEE7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rdh13Q8CEE7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh13Q8CEE7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms