Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam228aQ8CDW1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam228aQ8CDW1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam228aQ8CDW1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms