Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc38Q8CDN8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc38Q8CDN8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms