Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pabpn1Q8CCS6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpn1Q8CCS6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms