Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb1Q8CBF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb1Q8CBF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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