Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms