Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dclre1bQ8C7W7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms