Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stbd1Q8C7E7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stbd1Q8C7E7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms