Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc22Q8C5N3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc22Q8C5N3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms