Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FarsaQ8C0C7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FarsaQ8C0C7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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