Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh12Q8BYK4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms