Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp47Q8BY87 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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Usp47Q8BY87 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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Usp47Q8BY87 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Usp47Q8BY87 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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Usp47Q8BY87 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp47Q8BY87 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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