Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec22cQ8BXT9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22cQ8BXT9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms