Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn17Q8BXA6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn17Q8BXA6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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