Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp38Q8BW70 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp38Q8BW70 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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