Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup54Q8BTS4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms