Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PcgF3Q8BTQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcgF3Q8BTQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159 ms