Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BP99 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BP99 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BP99 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BP99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BP99 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BP99 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8BP99 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms