Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms