Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap4Q8BMK4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap4Q8BMK4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms