Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms