Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fbxo38Q8BMI0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms