Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rufy1Q8BIJ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rufy1Q8BIJ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms