Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdca8Q8BHX3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdca8Q8BHX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms