Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp4f39Q8BGU0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms