Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms