Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms