Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd4Q8BFT6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms