Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc172Q810N9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc172Q810N9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms