Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ChfrQ810L3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChfrQ810L3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms