Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cracr2bQ80ZJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms