Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AknaQ80VW7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AknaQ80VW7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms