Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma8aQ80VM8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnma8aQ80VM8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms