Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcmf1Q80UY2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcmf1Q80UY2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms