Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo2Q7TSY8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo2Q7TSY8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms