Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnfsf18Q7TS55 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms