Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stk40Q7TNL3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stk40Q7TNL3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms