Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sbno2Q7TNB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sbno2Q7TNB8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms