Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn4bQ7M729 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn4bQ7M729 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn4bQ7M729 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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