Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms