Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim12Q78RX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms