Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snd1Q78PY7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snd1Q78PY7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms