Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms