Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd3Q6ZQK0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd3Q6ZQK0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms